Le mercredi 25 novembre 2009, Marie-Noëlle Servage, Secrétaire Générale de la Fédération Française de Basket, a effectué le tirage au sort de la Coupe de France féminine Joe Jaunay.

Tous les clubs entrent en compétition dès le 1er tour, à savoir les 14 équipes de LFB, 15 équipes de NF1 (le Centre Fédéral est exempt) et trois équipes issues du Trophée Coupe de France (Perpignan, Villeubanne et Ouistrehanm - NF2).

Les clubs sont regroupés en quatre zones géographiques pour le premier tour (1/16è de finale) et  tirés au sort. Les rencontres des 1/8è de finale prennent en compte les résultats du premier tour (tableau). Un nouveau tirage au sort intégral a eu lieu pour les quarts de finale ainsi que pour les demi-finales. Ces demi-finales auront lieu le dimanche 18 avril 2010 à Boé (Lot-et-Garonne).

1/16è de finale : Samedi 23 janvier 2010
1/8è de finale : Samedi 27 février et 13 mars 2010
Quarts de finale : Samedi 27 mars 2010
Demi-finales : Dimanche 18 avril 2010, plateau à Boé (Lot-et-Garonne)
Finale : 16 mai 2010 (Palais Omnisports Paris-Bercy) 

Les résultats des 1/8è de finale

Roche Vendée (NF1) - Toulouse 74-62
Union Hainaut (NF1) - Arras 42-78
Charleville-Mézières (NF1) - Armentières 70-58
Basket Landes - Tarbes 62-87
Pleyber Christ (NF1) - Bourges 43-71
Union Lyon (NF1) - Pays d'Aix 69-88
Challes-les-Eaux - Lattes Montpellier 65-60
Mondeville - Nantes Rezé 70-66

Les résultats des 1/4 de finale

Roche Vendée (NF1) - Tarbes 54-61
Bourges - Arras 78-69
Charleville-Mézières (NF1) - Pays d'Aix 70-57
Challes-les-Eaux - Mondeville 70-79

Les résultats des 1/2 finales (plateau à Boé)

Bourges - Charleville-Mézières (NF1) 41-65
Mondeville - Tarbes 63-83

Le programme de la finale

Dimanche 16 mai 2010 à Bercy (14h15)
Bourges - Tarbes

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En gras les clubs de Ligue Féminine